“ชินโนะสุเกะ” ต้องเผชิญกับวิกฤตเมื่อชายหนุ่มที่อ้างว่าเป็นลูกชายของเขาจากอนาคต (เอย์จิ) เดินทางมาเตือนเรื่องระบบ “ไดรฟ์” ที่จะทำลายโลก ในขณะเดียวกัน มาสค์ไรเดอร์ปริศนา ...

เรโรงเรียนมัธยมปลาย ทั้งโรงเรียนถูก ฟ้าผ่า และถูกพาย้อนเวลาไปยัง ยุคเซ็นโกคุ (ศตวรรษที่ 16) อาโออิ นิชิโนะ (นักเรียนชมรมยิงธนู) และเพื่อน ๆ ที่มีทักษะจาก ชมรมกีฬา ต่างๆ ...