สิบปีหลังจากการเสียชีวิตของคิระ (ยางามิ ไลท์) และ L โลกต้องเผชิญกับภัยคุกคามใหม่ เมื่อมีสมุดมรณะถึง 6 เล่มตกลงสู่โลกมนุษย์พร้อมกัน ซึ่งเป็นจำนวนสูงสุดที่สามารถมีได้ หน่วยเฉพาะกิจปราบปรามสมุดมรณะนำโดย มิชิมะ ซึคุรุ (Masahiro Higashide) และ ริวซากิ (Sosuke Ikematsu) ผู้สืบทอดเจตนารมณ์ของ L ต้องร่วมมือกันเพื่อตามล่าสมุดทั้ง 6 เล่ม ขณะเดียวกัน ยูกิ ชิเอน (Masaki Suda) ผู้ก่อการร้ายไซเบอร์ผู้คลั่งไคล้คิระก็พยายามรวบรวมสมุดทั้งหมดเพื่อสร้างโลกใหม่