เมื่อ “โชมะ” (มาสค์ไรเดอร์กาบุ) ได้รับเบาะแสเกี่ยวกับ “บ้านขนมหวาน” ปริศนาที่ปรากฏขึ้นกลางเมือง ซึ่งแท้จริงแล้วเป็นกับดักของเหล่า “กรานูต” ...

เมื่อชายปริศนานามว่า “เอส” (มาสค์ไรเดอร์อีเดน) ประกาศจะทำลายโลกภายในเวลา 60 นาทีผ่านการโจมตีของผู้ก่อการร้ายทั่วโลก ฮิเด็น อารุโตะ ...

เมื่อประวัติศาสตร์ถูกบิดเบือนโดย “ฟีนิส” ไทม์แจ็คเกอร์คนใหม่ ทำให้โลกของ “ฮิเด็น อารุโตะ” (เซโร่วัน) เปลี่ยนไป ฮิวแมนเกียร์กลายเป็นผู้ครองโลกและมนุษย์ต้องอยู่อย่างหลบซ่อน ...

การผจญภัยข้ามมิติในฤดูร้อนเริ่มต้นขึ้นเมื่อโชวมะพลัดหลงผ่านประตูปริศนาสู่โลกที่ไร้ขนมแห่งความมืด ที่นั่นเขาได้พบกับทาโอะริน ชายหนุ่มผู้ใช้พลังกาบุที่สูญเสียความทรงจำ ...