เมื่อประวัติศาสตร์ถูกบิดเบือนโดย “ฟีนิส” ไทม์แจ็คเกอร์คนใหม่ ทำให้โลกของ “ฮิเด็น อารุโตะ” (เซโร่วัน) เปลี่ยนไป ฮิวแมนเกียร์กลายเป็นผู้ครองโลกและมนุษย์ต้องอยู่อย่างหลบซ่อน อารุโตะสูญเสียพลังไปและต้องย้อนเวลากลับไปยังเหตุการณ์ “เดย์เบรค” ร่วมกับ “โทกิวะ โซโกะ” (จีโอ) เพื่อค้นหาความจริงเกี่ยวกับพ่อของเขา “ฮิเด็น โซเรโอะ” และความลับของการกำเนิดมาสค์ไรเดอร์ตัวแรกของยุคเรย์วะ