เรื่องราวเริ่มต้นเมื่อโนบิตะอยากออกไปตามล่าหาขุมทรัพย์กลางมหาสมุทร โดราเอมอนจึงใช้ของวิเศษค้นหาจนพบเบาะแสของเกาะมหาสมบัติลึกลับ แต่ในระหว่างการเดินทาง พวกเขาถูกโจมตีโดย “โจรสลัด” ...